| | Project Number | Project Name | Budget | Position | Faculty Member | Project State |
| Tübitak 1001 | 124M416 | Hemodynamic Simulation of Supra Left Ventricular Heart Blood Flow Coupled with Coronary Arteries | 1.650.000 TL | Project Coordinator | M. Serdar Çelebi | Active |
| BAP | | Antibiyotik Direncine Karşı Bakteriyel Ribozom üzerinde Kod Çözücü ve Peptidil Transferaz Merkezlerinin Doğal Ürünlerle İnbisyonu: Makine Öğrenmesi Destekli In-Silico Çalışma | 285.000 TL | Project Coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Active |
| Tübitak-PIA Bosphorous | 115Z860 | Multiscale Mechanistic Study of Protein Arginine Deiminase 2: an attractive therapeutic target for breast cancer | 122.100 TL | Project Coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 115Z502 | O-Asetilpeptidoglukan Esteraz (Ape1) Enziminin Deasetilasyon Tepkime Mekanizmasının in Silico Yöntemlerle Aydınlatılması ve İnhibitör Tasarımı | 253.591 TL | Project Coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 113M439 | Kronik Inflamatuvar Deri Hastalıklarının Topikal Tedavisinde Kullanılacak Kontrollüİlaç Salım Sistemi Tasarımı: Steroid YüklüMOF/Pektin İçeren Yara Örtüsü | | Consultant | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 116Y136 | Integration of in-situ visualization approach with coupled
atmosphere-ocean modeling system to study fast- moving physical processes in atmosphere-sea
interaction.
| 393.967 TL | Project Coordinator | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| Tübitak | 114Y114
| Fırat & Dicle Havzasında İnsan
Kaynaklı İklim Değişiklikleri.
| | Research Scientist | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| Tübitak-RFBR | 213M523 | Hidrojenlenmiş Grafen Tabakaları Ve Karbon Nanotüp Yapılardan Oluşmuş Sistemlerin Temel Karakteristiklerinin Ve Isıl Kararlılıklarının Atomik Mekanizmalarının Yakıt Pili İle Çalışan Ekolojik Taşıtlardaki Hidrojen Depolama Problemine Etkisinin Belirlenmesi | 39.960 TL | Researcher | Adem Tekin | Completed |
| Tübitak | 114Z529 | Nükleik Asit Bazları İçin Kuvvet Alanı Geliştirilmesi | 220.159 TL | Project Coordinator | Adem Tekin | Completed |
| Tübitak | 117M430
| Computational Modeling of Deep Vein Thrombosis | 331.816 TL | Project Coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| Roketsan | | Computational Modeling of Micro Gravity Propellant Slosh Dynamics | 99.650 TL | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Blood Flow Simulation in Human Arterial Tree | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | A Study on Sub Grid Scale model for Severe Liquid Sloshing in a confined container | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| TUBITAK | 115S801 | Hedefli Kanser Tedavisine Yönelik
PLGA-MMT Nano Kompozitinin Üretimi ve Moleküler Dinamik Simülasyon İle İncelenmesi | 97.550 TL | Researcher | Adem Tekin | Completed |
| BAP | 38312 | Metal amin tuzlarında tersinir ve yüksek yoğunlukta hidrojen depolama | 25.000 TL | Project coordinator | Adem Tekin | Completed |
| AB PRACE-4IP (H2020) | 653838 | Persistent pan-European Research Infrastructure for High Performance Computing (HPC) | 15 000 000 Avro | Member of Management Board | Enver Özdemir | Completed |
| AB PRACE-5IP (H2020) | 730913 | Persistent pan-European Research Infrastructure for High Performance Computing (HPC) | 15 000 000 Avro | Member of Management Board | Enver Özdemir | Completed |
| Tübitak | 113Z218 | Siklopropenyum Aktivasyonlu Dehidrasyon Tepkime Mekanizmalarının Aydınlatılması :Hesapsal bir Yaklasım | 90.500TL | Project coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 105E067 | Computational Science and Engineering Program A Centre of Excellence for Industrial Innovation | 418.000TL | Project Coordinator Assistant | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 105E067 | Hesaplamalı Bilim ve Mühendislik Programı Endüstriyel Yenilik İçin Bir Mükemmelliyet Merkezi | | Researcher | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| İTÜ-BAP | | Doymamiş Siklik Asetal Ve Ketallerin Karbenlerle Tepkimesindeki Ürünlerin Dağilimini Ve Oksonyum/ Karbonyum Ylidlerin Oluşumunu Etkileyen Faktörler Üzerine Hesapsal Bir Çalişma | | Project coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 108T344 | Gamma Aminobütirikasit Aminotransferaz (Gaba-At) Enziminin Vigabatrin ile Etkisizleştirilme Mekanizması: Hesapsal Bir Çalışma | 55.000TL | Project coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 104T403 | Doymamış Siklik Asetal Ve Ketallerin Karbenlerle Tepkimesindeki Ürünlerin Dağılımını Ve Oksonyum/Karbonyum Ylidlerin Oluşumunu Etkileyen Faktörler Üzerine Hesapsal Bir Çalışma | | Researcher | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak-PIA | 113F342 | Born-Oppenheimer Molecular Dynamics of Very Large Biological Systems using Linear Scaling Approximate Quantum Methods | | Researcher | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| İTÜ-BAP | | Asimetrik Kinugasa Tepkime Mekanizmasının Modellenmesi | 30.000TL | Project coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
| Tübitak | 108T344 | Gamma Aminobütirikasit Aminotransferaz (Gaba-At) Enziminin Vigabatrin ile Etkisizleştirilme Mekanizması: Hesapsal Bir Çalışma” | | Project coordinator | Fethiye Aylin Sungur | Completed |
Tübitak
| 113Y108 | Akdeniz ve Karadeniz’in Türkiye iklim sistemine etkisinin birleşik bir atmosfer-okyanus modeli ile incelenmesi | 239.980 TL | Project coordinator | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| EU-FP7 | | Infrastructure for Analysis and
Experimentation on Ecosystems | | Research Scientist | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| UN-UNDP | MDG-F-1680-ITU | Enhancing The Capacity of Turkey to Adapt to Climate Change | | Researcher | Ufuk U. Turuncoglu | Completed
|
| Tübitak | 108Y064 | Avrupa Kaynaklı Kirleticilerin Türkiye’ye taşınımının Belirlenmesi: Model Sisteminin hazırlanması (Meteorolojik-Emisyon-Hava Kirliliği Modellemesi) ve
Klimatolojik Değerlendirme. | | Advisor | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| Tübitak | 106G029 | Rize il genelinde Afet Bilgi ve Meteorolojik Erken Uyarı Sistemi Kurulması (RABIS) | | Researcher | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| Tübitak | 105Y046 | Türkiye çevresindeki nükleer enerji santrallerinin bir kaz durumuna Türkiye’ye olası tehditleri: Yörünge (Tracer & Trajectory) Analizleri. | | Researcher | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| Tübitak | 105G015 | Türkiye için İklim Senaryolarının Oluşturulması | | Researcher | Ufuk U. Turuncoglu | Completed |
| Tübitak-RFBR | 213M523 | Hidrojenlenmiş Grafen Tabakaları Ve Karbon Nanotüp Yapılardan Oluşmuş Sistemlerin Temel Karakteristiklerinin Ve Isıl Kararlılıklarının Atomik Mekanizmalarının Yakıt Pili İle Çalışan Ekolojik Taşıtlardaki Hidrojen Depolama Problemine Etkisinin Belirlenmesi | 39.960 TL | Researcher | Adem Tekin | Completed |
| Tübitak | 112T988 | Amin Metal Bor Hidrürlerin Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi ile Tasarımı | 193.500 TL | Project coordinator | Adem Tekin | Completed |
| Tübitak | | Intermolecular Interactions in DNA bases | 89.000 TL | Project coordinator | Adem Tekin | Completed |
| e-COST | | Network for Sustainable Ultrascale Computing (NESUS) | | Member | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | A Numerical Approach for Growing and Remodelling of Soft Tissues | | Project Coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| Saudi ARAMCO | | Parallel Algorithm (Kernel) Development for Large Scale Sparse Linear Systems in Oil Reservoir Simulation (PASSOR) | 265.000USD | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| FP7 | | VPH NoE: Virtual Physiological Human Network of Excellence | | | M. Serdar Çelebi | Completed |
| AB PRACE-2IP | | Persistent pan-European Research Infrastructure for High Performance Computing (HPC) | 560K Avro | Contact Person of Turkey | M. Serdar Çelebi | 01.09.2011 - 01.09.2013 |
| AB PRACE-1IP | | Persistent pan-European Research Infrastructure for High Performance Computing (HPC) | 489K Avro | Contact Person of Turkey | M. Serdar Çelebi | 01.07.2010 - 01.07.2012 |
| DPT | | National Center for High Performance Computing (UHeM) | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| DPT | | Education and Research project for Advanced Technologies in Engineering | | Coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | ITU Digital E-Thesis Project | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Preparing the Required Libraries and Radiographs for Studying Human Chest X-Ray Images using Convolution Neural Network (CNN) Methods | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Multidirectional Wave Modelling in Numerical Wave Tank | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Modelling and Time Domain Simulation of Free Surface and Nonlinear Wave-body Interactions | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Numerical Modelling of Liquid Sloshing in a Rigid Rectangular Tank | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Non-Newtonian Blood Flow Simulation in a Realistic Artery | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| BAP | | Estimation of Material Coefficients of Soft Tissue Using Experimental Data and Inverse Finite Element Method | | Project coordinator | M. Serdar Çelebi | Completed |
| TUBITAK | | Class Numbers of Real Quadratic Fields | 30 000 Avro | Principal Investigator | Enver Özdemir | Completed |